En el ambito de los intercambios, IFMSA-Argentina cuenta con dos programas. Por un lado el programa de Intercambios Profesionales es un programa educativo completo que ofrece pasantías a estudiantes de medicina en el extranjero. Desde el comienzo, en 1951, era evidente que el intercambio de estudiantes de medicina sería uno de los principales campos de acción en IFMSA. Ya en 1952, un total de 463 estudiantes pasaron un período de práctica en el extranjero, y hoy en día, sigue siendo la columna vertebral de la Federación y constituye su proyecto de más larga duración. Anualmente, alrededor de 13,000 estudiantes de más de 90 países viajan alrededor del mundo para descubrir nuevos sistemas de salud, nuevas culturas y mejorar su salud global y su comprensión intercultural.
Por otra parte, el programa de Intercambios de Investigacion, qe surge debido a que, desafortunadamente, muchos estudiantes de medicina no tienen la oportunidad de experimentar la investigación mientras están en la escuela de medicina. La investigación es esencial para el desarrollo de la medicina y sin ella, el campo médico nunca podría haber alcanzado la etapa en que se encuentra ahora con métodos innovadores de diagnóstico y tratamientos.